機内で殺人事件が発生し、さらには機長と副操縦士が意識不明となる中、絶体絶命のピンチに立たされたコナンはどう対処するのでしょうか？そしてピンチに力を助けてくれるのが、あのキッドなのです。 いつもは阿笠博士が出題するダジャレクイズを今回はキッドがやっているのも特徴。とにかくキッドにスポットライトが当たった一作と言ってもいいでしょう。

監督：山本泰一郎
脚本：古内一成
原作:臼井儀人

■時計じかけの魔天楼

記念すべき劇場版アニメの一作目。 工藤新一の誕生日の前日、火薬庫から爆薬が盗難に遭うというニュースを目撃。また、建築家として名を馳せている森谷が設計を手がけた黒川邸が放火されたということも知ります。その犯人から新一宛てに爆弾予告についての電話が来たことを受け、コナンは事件解決をするために、爆弾解除に奔走します。 爆弾が街中のあらゆるところに仕かけられますが、名推理のためになんとか爆破を食い止めます。そして爆弾は蘭がいる建物の元にもあることが判明。コナンと蘭は協力して爆発を防ごうとしますが、最後の爆弾解除に戸惑います。コナン達は無事生きて帰ることができるのでしょうか？ ゲストにお笑いコンビの二丁拳銃の二人も声優として登場しています。

監督：こだま兼嗣
脚本：古内一成
原作：青山剛昌
主な出演者：高山みなみ／山崎和佳奈／神谷明／山口勝平／緒方賢一／岩居由希子／大谷育江／高木渉／小堀裕之、川谷修士（2丁拳銃）

■第3位：ベイカー街の亡霊

工藤新一の父であり人気推理作家の工藤優作が原案を考えた仮想体感ゲームの完成披露宴パーティーに招待されたコナン達。子どもたちがそのゲームを体感する中で、実はそれがトラップだということが発覚。人工知能のノアズ・アークに占領されてしまい、ゲームを全てクリアできないと子どもたちの命を奪うルールが適用されます。 パーティーで起きた殺人事件を解くカギがゲームの中にあると踏んだコナンは、自らそのゲームに乗り、仮想空間へと飛び込みます。そこは19世紀末のロンドン。実在した殺人鬼の切り裂きジャックを追い求める物語が進行します。