新型N-WGNはノーマルモデル、カスタムモデル共に先代のN-WGNに比べプレスラインの少ないシンプルなボディ形状となっており、ホンダが以前に販売していた「ステップバン」を彷彿とさせるデザインとなっています。

新型N-WGNノーマルモデルの最大の特徴は、現行のN-BOXのノーマルモデルと同じく、ヘッドライト内部にLEDの丸いプロジェクターが採用されており、シンプルかつカワイイデザインが特徴です。

新型N-WGNカスタムモデルはノーマルモデルとは違い、ヘッドライトに9灯LEDスクエア形状が採用されています。また、専用のフロントバンパーやサイドのカラードガーニッシュ、シャークフィンアンテナなども採用されました。ノーマルモデルに比べ、可愛らしさはありませんが、他のカスタムモデルと比べ、ギラギラとした装飾は控えめでシンプルにまとまっています。

新型N-WGNは新型N-BOXと同じく直線的なデザインが採用。エアコンのコントロールユニットやセレクトレバーの位置なんかも似た配置になっており、操作性は良好です。

また、乗車姿勢の自由度も高く、ハンドルに関しては上下のチルト調整だけではなく、前後のチルト調整もできるため、色々な体型の方に合わせて調整可能としています。

先代モデルでは引き出し式のセンターテーブルが装備されていましたが、新型には引き継がれておらず、その代わりにエアコンコントロールユニット下にUSBジャックが装備されました。またリヤ席シート下に設置されていた傘などが入る横長のトレイは継承されており、今回は脱着可能とし、トレイ単体で洗うこともできます。

また、車内スペースに関しては、後席の床を15mm高くしてサイドシルトの段差をなくすことにより、乗り降りの際に足が引っかからないように改良されました。