PCRなどの自動化機器の価格は約1万から1万5000米ドル、MALDI-TOF MSシステムの価格は約15万から85万米ドルとなっています。学術研究機関では、予算が限られているため、このような高額な装置を購入することはできません。さらに、メンテナンス費用やその他の間接的な費用がかかるため、機器の総所有コストはさらに高額です。このことが、小規模なエンドユーザーの間で、重大な抑制要因となっています。


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