「ゆでたてのホタルイカを熱いうちに酢味噌で食べるのが自分としてはお勧めです」（水産研究所研究員）「定番の酢味噌和えの他、酢漬け、天ぷら、パスタ、昆布焼きなどが一般的です。その他に竜宮そうめん（刺身）もあります」（富山漁連職員）

ただし、ホタルイカの内蔵には旋尾線虫という寄生虫がいることがあり、これによる食中毒のリスクがある。そのため、生食用ホタルイカの取り扱いについては、2000年6月21日付けで厚生労働省から各都道府県に向け、しかるべき凍結処理または内臓除去処理をする必要がある旨が通達されている。

ホタルイカを生食したい場合は、それがきちんと凍結処理されたものか、内臓が取り除かれているものかを確認することを忘れずに。