織田信長（演：小栗旬）との対決に敗れ、京都を追われた足利義昭（演：尾上右近）。この時、室町幕府は滅亡した、そう理解されることが一般的です。
しかし、義昭は将軍であることをやめてはいませんでした。毛利輝元のもとへと移った義昭は、再び信長打倒の旗を掲げ、上杉謙信（演：工藤潤矢）らを巻き込んだ新たな信長包囲網を築き上げます。敗れてもなお立ち上がるその姿は、「傀儡」とは程遠いものでした。
やがて本能寺の変を経て時代は大きく動き、義昭はついに自ら将軍職を手放します。
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【豊臣兄弟！】共闘から決裂へ…織田信長と戦い続けた足利義昭(尾上右近)、執念の生涯［前編］［後編］では、「最後まで将軍であろうとした男」の執念の生涯を追います。